DNAnexus融资了1亿美元用于扩展其基因组数据分析平台

DNAnexus是一家为DNA序列数据提供数据分析和管理平台的公司,今天宣布在一轮由Perceptive Advisors和Northpond Ventures共同领导的投资中获得1亿美元。DNAnexus表示,这笔资金将促进公司的国际增长,使公司在发展基于云的临床测试产品的同时,能够为世界各地的医疗保健和生命科学组织提供服务。

DNAnexus的许多客户——包括前10名临床诊断公司中的8家、前10名制药公司中的7家以及100多家企业——都使用了这个机器学习应用平台。它们执行人工辅助的变体调用,这需要识别单核苷酸(DNA的组成部分)的替换和下一代测序数据的小插入和删除。他们依靠深度学习来处理病理、解释病历、从大规模数据中提取见解——蛋白质组学(蛋白质研究)和代谢组学(代谢产物研究)数据。

DNAnexus于2009年由斯坦福大学教授Serafim Batzoglou和Arend Sidow以及斯坦福大学计算机科学家Andreas Sundquist创立。三人的目标是通过一套基于云的服务解决DNA序列分析中计算基础设施的需求,他们很早就取得了成功。2013年10月,DNAnexus与贝勒医学院人类基因组测序中心合作进行了当时规模最大的云基因组分析,在430TB的数据中处理了3751个全基因组到10771个外泌体(基因组中已知编码蛋白质的区域)。

DNAnexus的客户使用亚马逊网络服务(AWS)的计算资源对序列数据进行分析并存储这些数据。使用DNAnexus的Apollo产品,客户可以上传和集成用于探索的数据集,包括使用一系列模型的临床、研究和现实世界的数据集。他们能够通过拖放图表来创建定制的仪表盘,提供每个队列的快照,并通过工具、图表和可视化来探索临床数据关联,这些工具、图表和可视化使数十亿数据点变得有意义。

DNAnexus的Titan是对Apollo的补充,是一个平台即服务的产品,可扩展到数千台机器和数百万件物品。它通过让客户创建、细化、验证和执行管道,并自动跟踪数据来源,以及让团队成员在控制访问和安全的同时与协作者共享数据、工具和分析,来标准化数据。

产品轮盘的最后一个话题——门户——为组织提供了一个展示项目的空间,包括数据集、发布的工具以及新闻和亮点。公司可以使用门户向用户和合作伙伴显示包含可配置小部件的自定义登录页面,并选择和托管用户可以动态访问的特定版本的应用程序和工作流。门户可以根据需要将支持请求路由到客户代理,从而提供健壮的帮助文档库,并且可以提供请求和批准表单,以允许用户访问、浏览和检查数据。

DNAnexus声称到目前为止已经处理了超过14PB的数据,存储了28PB的数据,它的客户现在每月运行超过100,000个计算任务,在AWS上总计超过1000万核心处理小时。该公司为英国生物库(一组从50万志愿者中收集的临床记录数据)和国家生物技术信息中心的序列阅读档案提供搜索和分析工具。它继续与谷歌Brain成员合作,改进DeepVariant,这是一种由谷歌Brain开发的基因组变体调用者,它利用人工智能模型来发现基因组中的遗传变异。

通过与微软的合作,DNAnexus为St. Jude Cloud提供了访问世界上最大的儿童癌症基因组数据公共知识库的途径,以加速挖掘、分析和可视化能力。Titan支持脊椎动物基因组项目,该项目希望为所有66000种脊椎动物生成具有参考价值的基因组集合。DNAnexus建立了PrecisionFDA,一个由美国食品和药物管理局支持的用于社区基因组信息共享的开源平台。

参与DNAnexus最新一轮融资的投资者包括GV(前谷歌Ventures)、Foresite Capital、TPG资本(TPG Capital)、First round Capital和首次股权投资公司Regeneron Pharmaceuticals。继2019年2月F轮融资6800万美元之后,此次G轮融资使公司总融资超过2.7亿美元。

DNAnexus总部位于加州山景城,在旧金山、伦敦和布拉格设有办事处。

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